Hierarchy For All Packages

Package Hierarchies:

• chemaxon.calculations,
• chemaxon.calculations.cip,
• chemaxon.calculations.clean,
• chemaxon.calculations.dipole,
• chemaxon.calculations.hydrogenize,
• chemaxon.calculations.nmr,
• chemaxon.calculations.stereo,
• chemaxon.checkers,
• chemaxon.checkers.result,
• chemaxon.checkers.runner,
• chemaxon.checkers.runner.configuration.reader,
• chemaxon.common.util,
• chemaxon.core,
• chemaxon.core.calculations.stereo,
• chemaxon.core.calculations.valencecheck,
• chemaxon.fixers,
• chemaxon.formats,
• chemaxon.formats.documents.jchemexcel,
• chemaxon.formats.recognizer,
• chemaxon.jep,
• chemaxon.jep.context,
• chemaxon.license,
• chemaxon.marvin,
• chemaxon.marvin.alignment,
• chemaxon.marvin.beans,
• chemaxon.marvin.calculations,
• chemaxon.marvin.common,
• chemaxon.marvin.io,
• chemaxon.marvin.io.formats,
• chemaxon.marvin.io.formats.mdl,
• chemaxon.marvin.io.formats.smiles,
• chemaxon.marvin.modules.datatransfer,
• chemaxon.marvin.paint,
• chemaxon.marvin.plugin,
• chemaxon.marvin.plugin.concurrent,
• chemaxon.marvin.plugin.gui,
• chemaxon.marvin.services,
• chemaxon.marvin.services.httpservice,
• chemaxon.marvin.services.json,
• chemaxon.marvin.services.localservice,
• chemaxon.marvin.services.soap,
• chemaxon.marvin.services.xmlrpcservice,
• chemaxon.marvin.sketch,
• chemaxon.marvin.space,
• chemaxon.marvin.space.monitor,
• chemaxon.marvin.util,
• chemaxon.marvin.util.codeassist,
• chemaxon.marvin.view,
• chemaxon.marvin.view.swing,
• chemaxon.naming,
• chemaxon.struc,
• chemaxon.struc.graphics,
• chemaxon.struc.prop,
• chemaxon.struc.sgroup,
• chemaxon.util,
• chemaxon.util.concurrent,
• chemaxon.util.concurrent.marvin,
• chemaxon.util.concurrent.processors,
• chemaxon.util.iterator,
• com.chemaxon.calculations.solubility,
• com.chemaxon.calculations.stereoanal,
• com.chemaxon.calculations.stereoanal.filters,
• com.chemaxon.calculations.stereoanal.filters.atrop,
• com.chemaxon.calculations.stereoanal.filters.axial,
• com.chemaxon.calculations.stereoanal.filters.cistrans,
• com.chemaxon.calculations.stereoanal.filters.tetrahedral,
• com.chemaxon.calculations.stereoanal.stereocenters,
• com.chemaxon.common.annotations,
• com.chemaxon.mapper,
• com.chemaxon.version

Class Hierarchy

• java.lang.Object
  • chemaxon.checkers.AbbreviatedGroupChecker.Abbreviations
  • chemaxon.struc.AbstractAtropStereoDescriptor<T> (implements chemaxon.struc.CIPStereoDescriptorIface)
    • chemaxon.struc.AtropStereoDescriptor
  • chemaxon.struc.AbstractAxialStereoDescriptor<T> (implements chemaxon.struc.CIPStereoDescriptorIface)
    • chemaxon.struc.AxialStereoDescriptor
  • javax.swing.AbstractCellEditor (implements javax.swing.CellEditor, java.io.Serializable)
    • chemaxon.marvin.beans.MViewEditor (implements javax.swing.table.TableCellEditor)
  • chemaxon.struc.AbstractCisTransStereoDescriptor<T> (implements chemaxon.struc.CIPStereoDescriptorIface)
    • chemaxon.struc.CisTransStereoDescriptor
  • chemaxon.marvin.io.formats.AbstractMRecordReader (implements chemaxon.marvin.io.MRecordReader)
  • com.chemaxon.calculations.stereoanal.filters.AbstractStereoFilter<T>
    • com.chemaxon.calculations.stereoanal.filters.atrop.AtropFilter
    • com.chemaxon.calculations.stereoanal.filters.axial.AxialFilter
    • com.chemaxon.calculations.stereoanal.filters.cistrans.CisDoubleBondFilter
    • com.chemaxon.calculations.stereoanal.filters.cistrans.CisTransDoubleBondFilter
    • com.chemaxon.calculations.stereoanal.filters.HasAttachedDataFilter
    • com.chemaxon.calculations.stereoanal.filters.atrop.KnownAtropFilter
    • com.chemaxon.calculations.stereoanal.filters.axial.KnownAxialFilter
    • com.chemaxon.calculations.stereoanal.filters.tetrahedral.KnownResolvedTetrahedralFilter
    • com.chemaxon.calculations.stereoanal.filters.tetrahedral.RacemicTetrahedralFilter
    • com.chemaxon.calculations.stereoanal.filters.tetrahedral.TetrahedralFilter
    • com.chemaxon.calculations.stereoanal.filters.cistrans.TransDoubleBondFilter
    • com.chemaxon.calculations.stereoanal.filters.atrop.UnknownAtropFilter
    • com.chemaxon.calculations.stereoanal.filters.axial.UnknownAxialFilter
    • com.chemaxon.calculations.stereoanal.filters.tetrahedral.UnknownResolvedTetrahedralFilter
    • com.chemaxon.calculations.stereoanal.filters.tetrahedral.UnresolvedTetrahedralFilter
  • chemaxon.checkers.AbstractStructureChecker (implements java.lang.Cloneable, chemaxon.license.Licensable, java.beans.PropertyChangeListener, chemaxon.checkers.StructureChecker)
    • chemaxon.checkers.AbbreviatedGroupChecker
    • chemaxon.checkers.AbsentChiralFlagChecker
    • chemaxon.checkers.AbsoluteStereoConfigurationChecker
    • chemaxon.checkers.AromaticityErrorChecker
    • chemaxon.checkers.AtropisomerChecker
    • chemaxon.checkers.AttachedDataChecker
    • chemaxon.checkers.BondAngleChecker
    • chemaxon.checkers.BondLengthChecker
    • chemaxon.checkers.ChiralFlagChecker
    • chemaxon.checkers.ChiralFlagErrorChecker
    • chemaxon.checkers.CircularRGroupReferenceChecker
    • chemaxon.checkers.ComponentChecker<E>
      • chemaxon.checkers.AtomChecker
        • chemaxon.checkers.AliasChecker
        • chemaxon.checkers.AtomMapChecker
        • chemaxon.checkers.AtomQueryPropertyChecker
        • chemaxon.checkers.AtomTypeChecker
          • chemaxon.checkers.RareElementChecker
        • chemaxon.checkers.AtomValueChecker
        • chemaxon.checkers.ExplicitLonePairChecker
        • chemaxon.checkers.IsotopeChecker
        • chemaxon.checkers.MissingAtomMapChecker
        • chemaxon.checkers.MultiCenterChecker
        • chemaxon.checkers.OverlappingAtomsChecker
        • chemaxon.checkers.PseudoAtomChecker
        • chemaxon.checkers.QueryAtomChecker
        • chemaxon.checkers.RacemateChecker
        • chemaxon.checkers.RadicalChecker
        • chemaxon.checkers.StarAtomChecker
        • chemaxon.checkers.StereoInversionRetentionMarkChecker
        • chemaxon.checkers.ThreeDimensionChecker
        • chemaxon.checkers.ValencePropertyChecker
      • chemaxon.checkers.BondChecker
        • chemaxon.checkers.CrossedDoubleBondChecker
        • chemaxon.checkers.OverlappingBondsChecker
        • chemaxon.checkers.QueryBondChecker
        • chemaxon.checkers.ReactingCenterBondMarkChecker
        • chemaxon.checkers.StraightDoubleBondChecker
    • chemaxon.checkers.CoordinationSystemErrorChecker
    • chemaxon.checkers.CovalentCounterionChecker
    • chemaxon.checkers.EmptyStructureChecker
    • chemaxon.checkers.ExplicitHydrogenChecker
    • chemaxon.checkers.ExternalStructureChecker
    • chemaxon.checkers.EZDoubleBondChecker
    • chemaxon.checkers.MetalloceneErrorChecker
    • chemaxon.checkers.MissingRGroupChecker
    • chemaxon.checkers.MoleculeChargeChecker
    • chemaxon.checkers.MultiComponentChecker
    • chemaxon.checkers.MultipleStereocenterChecker
    • chemaxon.checkers.OCRErrorChecker
    • chemaxon.checkers.RatomChecker
    • chemaxon.checkers.ReactionChecker
      • chemaxon.checkers.ReactionMapErrorChecker
    • chemaxon.checkers.RelativeStereoChecker
    • chemaxon.checkers.RgroupAttachmentCountErrorChecker
    • chemaxon.checkers.RgroupAttachmentErrorChecker
    • chemaxon.checkers.RgroupOrphanAttachmentErrorChecker
    • chemaxon.checkers.RgroupReferenceErrorChecker
    • chemaxon.checkers.RingStrainErrorChecker
    • chemaxon.checkers.SolventChecker
    • chemaxon.checkers.StereoCareBoxChecker
    • chemaxon.checkers.SubstructureChecker
    • chemaxon.checkers.UnbalancedReactionChecker
    • chemaxon.checkers.UnusedRGroupChecker
    • chemaxon.checkers.ValenceErrorChecker
    • chemaxon.checkers.WedgeErrorChecker
    • chemaxon.checkers.WigglyBondChecker
    • chemaxon.checkers.WigglyDoubleBondChecker
  • chemaxon.fixers.AbstractStructureFixer (implements chemaxon.fixers.StructureFixer)
    • chemaxon.fixers.AbsentChiralFlagFixer
    • chemaxon.fixers.AbsoluteStereoFixer
    • chemaxon.fixers.AddChiralFlagFixer
    • chemaxon.fixers.BondAngleFixer
    • chemaxon.fixers.BondLengthFixer
    • chemaxon.fixers.CleanFixer
    • chemaxon.fixers.ContractGroupFixer
    • chemaxon.fixers.ConvertAliasToGroupFixer
    • chemaxon.fixers.ConvertPseudoToGroupFixer
    • chemaxon.fixers.ConvertToAtomFixer
    • chemaxon.fixers.ConvertToCarbonFixer
    • chemaxon.fixers.ConvertToCrossedDoubleBondFixer
    • chemaxon.fixers.ConvertToElementalFormFixer
    • chemaxon.fixers.ConvertToIonicFormFixer
    • chemaxon.fixers.ConvertToPlainDoubleBondFixer
    • chemaxon.fixers.ConvertToSingleBondFixer
    • chemaxon.fixers.ConvertToWigglyDoubleBondFixer
    • chemaxon.fixers.CovalentCounterionFixer
    • chemaxon.fixers.CrossedDoubleBondFixer
    • chemaxon.fixers.DearomatizeFixer
    • chemaxon.fixers.DistanceBasedMetalloceneFixer
    • chemaxon.fixers.ExpandGroupFixer
    • chemaxon.fixers.ExplicitHydrogenFixer
    • chemaxon.fixers.IsotopeFixer
    • chemaxon.fixers.MapMoleculeFixer
    • chemaxon.fixers.MapReactionFixer
    • chemaxon.fixers.MetalloceneFixer
    • chemaxon.fixers.NeutralizeChargeFixer
    • chemaxon.fixers.PartialCleanFixer
    • chemaxon.fixers.RearomatizeFixer
    • chemaxon.fixers.RemoveAliasFixer
    • chemaxon.fixers.RemoveAtomFixer
    • chemaxon.fixers.RemoveAtomMapFixer
    • chemaxon.fixers.RemoveAtomQueryPropertyFixer
    • chemaxon.fixers.RemoveAtomValueFixer
    • chemaxon.fixers.RemoveAttachedDataFixer
    • chemaxon.fixers.RemoveBondFixer
    • chemaxon.fixers.RemoveChiralFlagFixer
    • chemaxon.fixers.RemoveExplicitHydrogenFixer
    • chemaxon.fixers.RemoveInvalidChiralFlagFixer
    • chemaxon.fixers.RemoveRadicalFixer
    • chemaxon.fixers.RemoveReactingCenterBondMarkFixer
    • chemaxon.fixers.RemoveStereoCareBoxFixer
    • chemaxon.fixers.RemoveStereoInversionRetentionMarkFixer
    • chemaxon.fixers.RemoveUnreferencedRgroupDefinitionsFixer
    • chemaxon.fixers.RemoveValencePropertyFixer
    • chemaxon.fixers.RemoveZCoordinateFixer
    • chemaxon.fixers.RgroupAttachmentFixer
    • chemaxon.fixers.RgroupReferenceFixer
    • chemaxon.fixers.SubstructureFixer
    • chemaxon.fixers.UngroupFixer
    • chemaxon.fixers.ValenceFixer
    • chemaxon.fixers.WedgeCleanFixer
    • chemaxon.fixers.WigglyDoubleBondFixer
  • chemaxon.struc.AbstractTetrahedralStereoDescriptor<T> (implements chemaxon.struc.CIPStereoDescriptorIface)
    • chemaxon.struc.TetrahedralStereoDescriptor
  • chemaxon.checkers.runner.configuration.reader.ActionStringBasedConfigurationReader (implements chemaxon.checkers.runner.configuration.reader.ConfigurationReader)
  • chemaxon.marvin.alignment.Alignment
  • chemaxon.marvin.alignment.AlignmentMolecule
  • chemaxon.marvin.alignment.AlignmentMoleculeFactory
  • chemaxon.marvin.alignment.AlignOnPairedAtoms
  • chemaxon.marvin.alignment.AlignRigidEasy (implements chemaxon.license.Licensable)
  • chemaxon.struc.AtomProperty
  • chemaxon.marvin.space.AtomProperty
  • chemaxon.marvin.space.AtomProperty.MoleculeAtomProperty (implements chemaxon.struc.MoleculeIterators.AtomPropertyInterface)
  • chemaxon.marvin.space.AtomProperty.SmoleculeAtomProperty (implements chemaxon.struc.MoleculeIterators.AtomPropertyInterface)
  • com.chemaxon.calculations.stereoanal.stereocenters.AtomSelection
  • chemaxon.marvin.alignment.AtropIsomerDetector (implements chemaxon.license.Licensable)
  • com.chemaxon.calculations.stereoanal.stereocenters.AtropStereoCenter (implements com.chemaxon.calculations.stereoanal.stereocenters.StereoCenter)
  • com.chemaxon.calculations.stereoanal.stereocenters.AttachedData
  • com.chemaxon.mapper.AutoMapper (implements com.chemaxon.mapper.Mapper<T>)
  • com.chemaxon.mapper.AutoMapper.Options
  • com.chemaxon.calculations.stereoanal.stereocenters.AxialStereoCenter (implements com.chemaxon.calculations.stereoanal.stereocenters.StereoCenter)
  • chemaxon.checkers.runner.BasicCheckerRunner (implements chemaxon.checkers.runner.CheckerRunner)
    • chemaxon.checkers.runner.AdvancedCheckerRunner
    • chemaxon.checkers.runner.SketchCheckerRunner
  • chemaxon.marvin.space.BoundingBox
  • chemaxon.marvin.plugin.CalculatorPlugin (implements chemaxon.license.Licensable)
    • chemaxon.marvin.calculations.AlignmentPlugin
    • chemaxon.marvin.calculations.ConformerPlugin
    • chemaxon.marvin.calculations.ElementalAnalyserPlugin
    • chemaxon.marvin.calculations.GeometryPlugin
    • chemaxon.marvin.calculations.IonChargePlugin
    • chemaxon.marvin.calculations.IsoelectricPointPlugin
    • chemaxon.marvin.calculations.IUPACNamingPlugin
    • chemaxon.marvin.calculations.logDPlugin
    • chemaxon.marvin.calculations.logPPlugin
    • chemaxon.marvin.calculations.MajorMicrospeciesAccessorPlugin
      • chemaxon.marvin.calculations.ChargePlugin
      • chemaxon.marvin.calculations.HBDAPlugin
      • chemaxon.marvin.calculations.HuckelAnalysisPlugin
      • chemaxon.marvin.calculations.MSAPlugin
      • chemaxon.marvin.calculations.OrbitalElectronegativityPlugin
      • chemaxon.marvin.calculations.PolarizabilityPlugin
      • chemaxon.marvin.calculations.TPSAPlugin
    • chemaxon.marvin.calculations.MajorMicrospeciesPlugin
    • chemaxon.marvin.calculations.MarkushEnumerationPlugin
      • chemaxon.marvin.calculations.EnumerationPlugin
    • chemaxon.marvin.calculations.MolecularDynamicsPlugin
    • chemaxon.marvin.calculations.pKaPlugin
    • chemaxon.marvin.calculations.RefractivityPlugin
    • chemaxon.marvin.calculations.ResonancePlugin
    • chemaxon.marvin.calculations.StereoisomerPlugin
    • chemaxon.marvin.calculations.StructuralFrameworksPlugin
    • chemaxon.marvin.calculations.TautomerizationPlugin
    • chemaxon.marvin.calculations.TopologyAnalyserPlugin
  • chemaxon.marvin.plugin.CalculatorPlugin.HydrogenData
  • chemaxon.marvin.plugin.CalculatorPluginDisplay
  • chemaxon.marvin.plugin.CalculatorPluginOutput (implements chemaxon.marvin.plugin.CalculatorResultAccess)
  • chemaxon.marvin.space.CellOrComponentId
  • chemaxon.core.ChemConst
    • chemaxon.struc.PeriodicSystem
  • chemaxon.calculations.cip.CIPStereoCalculator
  • chemaxon.core.calculations.stereo.CIPStereoRecognizer
  • com.chemaxon.calculations.stereoanal.stereocenters.CisTransStereoCenter (implements com.chemaxon.calculations.stereoanal.stereocenters.StereoCenter)
  • chemaxon.calculations.clean.Cleaner
  • chemaxon.marvin.util.CleanUtil (implements chemaxon.struc.HybridizationStateConsts)
  • chemaxon.marvin.modules.datatransfer.ClipboardHandler
  • chemaxon.marvin.util.codeassist.CodeAssistFactory
  • chemaxon.marvin.util.codeassist.CodeAssistFactory.CodeAssistConfiguration
  • chemaxon.marvin.util.ColorGenerator
  • java.awt.Component (implements java.awt.image.ImageObserver, java.awt.MenuContainer, java.io.Serializable)
    • java.awt.Container
      • javax.swing.JComponent (implements java.io.Serializable)
        • javax.swing.JPanel (implements javax.accessibility.Accessible)
          • chemaxon.marvin.space.GraphicScene (implements chemaxon.marvin.util.CallbackIface, javax.media.opengl.GLEventListener)
          • chemaxon.marvin.beans.MolRenderer (implements javax.swing.table.TableCellRenderer)
          • chemaxon.marvin.plugin.gui.ParameterPanel (implements chemaxon.marvin.plugin.ParameterPanelHandler)
        • javax.swing.JRootPane (implements javax.accessibility.Accessible)
          • chemaxon.marvin.beans.MarvinPane (implements java.awt.event.ComponentListener, java.awt.event.KeyListener, java.beans.PropertyChangeListener)
            • chemaxon.marvin.beans.MSketchPane
            • chemaxon.marvin.beans.MViewPane
              • chemaxon.marvin.beans.MViewRenderer (implements javax.swing.table.TableCellRenderer)
      • java.awt.Window (implements javax.accessibility.Accessible)
        • java.awt.Dialog
          • javax.swing.JDialog (implements javax.accessibility.Accessible, javax.swing.RootPaneContainer, javax.swing.WindowConstants)
            • chemaxon.marvin.plugin.gui.OptionsPane (implements java.awt.event.ActionListener, java.awt.event.WindowListener)
  • chemaxon.marvin.space.ComponentElement
  • chemaxon.util.concurrent.marvin.CompositeInputProducer (implements chemaxon.util.concurrent.InputProducer<V>)
  • chemaxon.util.concurrent.marvin.CompositeWorkUnit (implements chemaxon.util.concurrent.WorkUnit)
  • chemaxon.util.concurrent.marvin.CompositeWorkUnitFactory (implements chemaxon.util.concurrent.WorkUnitFactory)
  • chemaxon.util.concurrent.processors.ConcurrentProcessors
  • chemaxon.marvin.space.monitor.Control
    • chemaxon.marvin.space.monitor.DihedralControl
    • chemaxon.marvin.space.monitor.GlobalLocationControl
    • chemaxon.marvin.space.monitor.GlobalOrientationControl
    • chemaxon.marvin.space.monitor.LocalLocationControl
    • chemaxon.marvin.space.monitor.LocalOrientationControl
    • chemaxon.marvin.space.monitor.ResizeControl
  • chemaxon.checkers.result.ConvertConstants
  • chemaxon.struc.CTransform3D (implements java.io.Externalizable)
  • chemaxon.checkers.result.DefaultStructureCheckerResult (implements chemaxon.checkers.result.StructureCheckerResult)
    • chemaxon.checkers.result.AromaticityCheckerResult
    • chemaxon.checkers.result.AtomQueryPropertyCheckerResult
    • chemaxon.checkers.result.BondAngleCheckerResult
    • chemaxon.checkers.result.BondLengthCheckerResult
    • chemaxon.checkers.result.DefaultExternalStructureCheckerResult (implements chemaxon.checkers.result.ExternalStructureCheckerResult)
    • chemaxon.checkers.result.ExplicitHydrogenResult
    • chemaxon.checkers.result.MetalloceneCheckerResult
    • chemaxon.checkers.result.ReactionCheckerResult
    • chemaxon.checkers.result.RgroupCheckerResult
    • chemaxon.checkers.result.SgroupCheckerResult
    • chemaxon.checkers.result.SubstructureCheckerResult
  • chemaxon.marvin.alignment.DihedralRotator
  • chemaxon.calculations.dipole.DipoleCalculator.Builder (implements chemaxon.calculator.CalculatorBuilder<T>)
  • chemaxon.calculations.dipole.DipoleResult
  • chemaxon.naming.DocumentExtractor
  • chemaxon.naming.DocumentExtractor.Hit
  • chemaxon.naming.DocumentExtractor.ProgressInfo (implements java.lang.Cloneable)
  • chemaxon.naming.DocumentToStructure
  • chemaxon.util.DotfileUtil
  • chemaxon.struc.DPoint3 (implements java.lang.Cloneable, java.io.Externalizable)
  • chemaxon.calculations.ElementalAnalyser
  • com.chemaxon.calculations.stereoanal.stereocenters.EnhancedStereo
  • com.chemaxon.calculations.stereoanal.stereocenters.EnhancedStereoGroup
  • com.chemaxon.calculations.stereoanal.ErrorReport
  • chemaxon.jep.Evaluator (implements java.io.Serializable)
  • chemaxon.fixers.FixerPriorityComparator (implements java.util.Comparator<T>)
  • chemaxon.marvin.space.GraphicCell
  • chemaxon.marvin.space.GraphicComponent (implements chemaxon.marvin.space.UsableObject)
    • chemaxon.marvin.space.MacroMoleculeComponent
    • chemaxon.marvin.space.MolecularSurfaceComponent (implements chemaxon.marvin.util.CallbackIface, chemaxon.marvin.space.UsableObject)
    • chemaxon.marvin.space.MoleculeComponent (implements chemaxon.marvin.space.MacroMoleculeComponent.MoleculeVisualizer, chemaxon.struc.MoleculeIterators.MoleculeInterface, chemaxon.marvin.space.UsableObject)
    • chemaxon.marvin.space.monitor.Monitor
      • chemaxon.marvin.space.monitor.Label
      • chemaxon.marvin.space.monitor.MeasurementMonitor
        • chemaxon.marvin.space.monitor.AngleMonitor
        • chemaxon.marvin.space.monitor.DihedralMonitor
        • chemaxon.marvin.space.monitor.DistanceMonitor
      • chemaxon.marvin.space.monitor.PositionMonitor
    • chemaxon.marvin.space.PharmacophoreArrow (implements chemaxon.marvin.space.UsableObject)
    • chemaxon.marvin.space.PharmacophorePoint (implements chemaxon.marvin.space.UsableObject)
    • chemaxon.marvin.space.SurfaceComponent
  • chemaxon.util.HitColoringAndAlignmentOptions (implements java.lang.Cloneable)
  • chemaxon.util.HitDisplayUtil
  • chemaxon.calculations.hydrogenize.Hydrogenize (implements chemaxon.struc.StereoConstants)
  • chemaxon.util.ImageExportUtil
  • java.io.InputStream (implements java.io.Closeable)
    • java.io.FilterInputStream
      • java.io.BufferedInputStream
        • chemaxon.marvin.io.PositionedInputStream
          • chemaxon.formats.MolInputStream
  • chemaxon.checkers.InvalidChecker (implements chemaxon.checkers.StructureChecker)
  • chemaxon.util.iterator.IteratorFactory
  • chemaxon.util.iterator.IteratorFactory.AtomIterator (implements java.util.Iterator<E>)
  • chemaxon.util.iterator.IteratorFactory.BondIterator (implements java.util.Iterator<E>)
  • chemaxon.util.iterator.IteratorFactory.NeighbourIterator<E> (implements java.util.Iterator<E>)
    • chemaxon.util.iterator.IteratorFactory.AtomNeighbourIterator
    • chemaxon.util.iterator.IteratorFactory.BondNeighbourIterator
  • chemaxon.util.iterator.IteratorFactory.RgComponentIterator (implements java.util.Iterator<E>)
  • chemaxon.util.iterator.IteratorFactory.RxnComponentIterator (implements java.util.Iterator<E>)
  • chemaxon.util.iterator.IteratorFactory.SgroupIterator (implements java.util.Iterator<E>)
  • chemaxon.formats.documents.jchemexcel.JChemExcelAPI
  • chemaxon.nfunk.jep.JEP (implements java.io.Serializable)
    • chemaxon.jep.ChemJEP (implements chemaxon.marvin.util.CallbackIface)
  • chemaxon.license.LicenseManager
  • chemaxon.marvin.modules.datatransfer.MarvinTransferable (implements chemaxon.marvin.modules.datatransfer.MTransferable)
  • chemaxon.formats.MdlCompressor
  • chemaxon.marvin.io.MDocSource (implements java.io.Closeable, java.lang.Iterable<T>)
    • chemaxon.marvin.io.ArrayMDocSource
    • chemaxon.formats.MolImporter (implements chemaxon.marvin.io.formats.MoleculeImporterIface)
  • chemaxon.marvin.view.MDocStorage
  • chemaxon.struc.MDocument (implements chemaxon.core.structure.DocumentForBuilder, chemaxon.struc.MTransformable, java.io.Serializable)
    • chemaxon.struc.MSelectionDocument
  • chemaxon.struc.MDocument.CheckerMark
  • chemaxon.marvin.io.MFieldAccessor
  • chemaxon.formats.MFileFormat
  • chemaxon.formats.MFileFormatUtil
  • chemaxon.struc.graphics.MFont (implements java.lang.Cloneable, java.io.Serializable)
  • chemaxon.marvin.alignment.MinMaxDistance
  • chemaxon.marvin.alignment.MMPAlignment
  • chemaxon.marvin.alignment.MMPAlignmentProperties
  • chemaxon.marvin.alignment.MMPAlignmentResult (implements chemaxon.marvin.alignment.AlignmentResult)
  • chemaxon.struc.MObject (implements java.lang.Cloneable, java.io.Serializable)
    • chemaxon.struc.graphics.MChemicalStruct
    • chemaxon.struc.MPoint
      • chemaxon.struc.graphics.MAtomSetPoint
      • chemaxon.struc.graphics.MEFlowBasePoint
      • chemaxon.struc.graphics.MMidPoint
        • chemaxon.struc.graphics.MMidPoint.Sticky
      • chemaxon.struc.graphics.MRectanglePoint
        • chemaxon.struc.graphics.MRectanglePoint.Sticky
    • chemaxon.struc.graphics.MPolyline
      • chemaxon.struc.graphics.MEFlow
      • chemaxon.struc.graphics.MRectangle
        • chemaxon.struc.graphics.MBracket
        • chemaxon.struc.graphics.MEllipse
        • chemaxon.struc.graphics.MRoundedRectangle
        • chemaxon.struc.graphics.MTextBox
  • chemaxon.util.MolAligner
  • chemaxon.struc.MolAtom (implements java.io.Serializable, chemaxon.struc.StereoConstants)
    • chemaxon.struc.sgroup.SgroupAtom
  • chemaxon.struc.MolBond (implements java.io.Serializable, chemaxon.struc.StereoConstants)
    • chemaxon.struc.QueryBond
  • chemaxon.jep.context.MolContext (implements chemaxon.jep.ChemContext)
    • chemaxon.jep.context.AtomContext
  • chemaxon.formats.MolConverter
  • chemaxon.formats.MolConverter.Builder
    • chemaxon.formats.MolConverter.Options
  • chemaxon.struc.MoleculeGraph (implements chemaxon.struc.Incomplecule, chemaxon.core.structure.MoleculeForBuilder, chemaxon.core.calculations.valencecheck.MoleculeWithValence<AtomReference>, chemaxon.struc.MTransformable, java.io.Serializable, chemaxon.struc.StereoConstants)
    • chemaxon.struc.Molecule (implements chemaxon.struc.MObjectContainer)
      • chemaxon.struc.RgMolecule (implements chemaxon.core.structure.MarkushStructureForBuilder, chemaxon.struc.MObjectContainer, chemaxon.struc.RgMoleculeGraphIface)
      • chemaxon.struc.RxnMolecule (implements chemaxon.struc.MObjectContainer, chemaxon.core.structure.ReactionForBuilder)
    • chemaxon.struc.SelectionMolecule
  • chemaxon.marvin.io.formats.MoleculeImporter (implements chemaxon.marvin.io.formats.MoleculeImporterIface)
  • chemaxon.util.iterator.MoleculeIteratorFactory
  • chemaxon.marvin.util.MoleculeUtil
  • chemaxon.formats.MolExporter
  • chemaxon.marvin.io.MolExportModule
    • chemaxon.marvin.io.formats.mdl.MolExport (implements chemaxon.struc.StereoConstants)
  • chemaxon.marvin.io.formats.mdl.MolfileUtil
  • chemaxon.marvin.util.MolFragLoader
  • chemaxon.marvin.util.MolFragLoader.RgroupAttachmentCountFilter (implements chemaxon.util.MolFilter)
  • chemaxon.marvin.util.MolImageSize (implements java.lang.Cloneable, java.io.Serializable)
  • chemaxon.marvin.io.MolImportModule
    • chemaxon.marvin.io.formats.mdl.MolImport (implements chemaxon.struc.StereoConstants)
  • chemaxon.util.concurrent.marvin.MolInputProducer (implements chemaxon.util.concurrent.InputProducer<V>)
  • chemaxon.marvin.MolPrinter
  • chemaxon.struc.MProp (implements java.lang.Cloneable, java.io.Serializable)
    • chemaxon.struc.prop.MBooleanProp
    • chemaxon.struc.prop.MCollectionProp
      • chemaxon.struc.prop.MHashProp
      • chemaxon.struc.prop.MListProp
    • chemaxon.struc.MDocument.Prop
    • chemaxon.struc.prop.MDoubleArrayProp
    • chemaxon.struc.prop.MDoubleProp
    • chemaxon.struc.prop.MHCoords3DProp (implements chemaxon.struc.MTransformable)
    • chemaxon.struc.prop.MIntegerArrayProp
    • chemaxon.struc.prop.MIntegerProp
    • chemaxon.struc.prop.MMoleculeProp
    • chemaxon.struc.prop.MObjectProp
    • chemaxon.struc.prop.MStringProp
  • chemaxon.struc.MPropertyContainer (implements java.lang.Cloneable, java.io.Externalizable)
  • chemaxon.marvin.io.MPropHandler
  • chemaxon.marvin.io.MRecord
  • chemaxon.marvin.io.MRecordImporter
  • chemaxon.marvin.io.MRecordReader.Position
  • chemaxon.marvin.beans.MSketch (implements java.io.Externalizable)
  • chemaxon.marvin.space.MSpaceEasy (implements chemaxon.marvin.util.CallbackIface)
  • chemaxon.struc.graphics.MTextAttributes (implements java.io.Externalizable)
  • chemaxon.struc.graphics.MTextDocument (implements java.io.Externalizable)
  • chemaxon.struc.graphics.MTextDocument.Portion
  • chemaxon.struc.graphics.MTextDocument.Section
  • chemaxon.marvin.beans.MView (implements java.io.Externalizable)
  • chemaxon.marvin.beans.MViewParams
  • chemaxon.naming.NameConverters
  • chemaxon.calculations.nmr.NMRCalculator.Builder (implements chemaxon.calculator.CalculatorBuilder<T>)
  • chemaxon.calculations.nmr.NMRSpectrum (implements chemaxon.calculations.nmr.Spectrum)
  • chemaxon.marvin.util.OptionDescriptor
  • chemaxon.marvin.alignment.PairwiseAlignment (implements chemaxon.marvin.alignment.PairwiseComparison)
  • chemaxon.marvin.alignment.PairwiseSimilarity3D (implements chemaxon.marvin.alignment.PairwiseComparison)
  • chemaxon.marvin.common.ParameterConstants
    • chemaxon.marvin.sketch.SketchParameterConstants
    • chemaxon.marvin.view.ViewParameterConstants
  • chemaxon.marvin.plugin.gui.ParameterTab
  • chemaxon.marvin.alignment.Pharmacophore3D
  • chemaxon.marvin.plugin.PluginFactory
  • chemaxon.marvin.plugin.PluginFactory.PluginRecord (implements java.lang.Comparable<T>)
  • chemaxon.marvin.plugin.concurrent.PluginWorkUnit (implements chemaxon.util.concurrent.WorkUnit)
    • chemaxon.marvin.plugin.concurrent.DefaultPluginWorkUnit
    • chemaxon.marvin.plugin.concurrent.ReusablePluginWorkUnit
  • chemaxon.calculator.ProgressableCalculator<T,R> (implements chemaxon.calculator.Calculator<T,R>, chemaxon.license.Licensable)
    • chemaxon.calculations.dipole.DipoleCalculator
    • chemaxon.calculations.nmr.NMRCalculator
  • chemaxon.jep.context.ReactionContext (implements chemaxon.jep.ChemContext)
  • chemaxon.formats.recognizer.Recognizer
    • chemaxon.formats.recognizer.AbbrevGroupRecognizer
    • chemaxon.formats.recognizer.Base64Recognizer
    • chemaxon.formats.recognizer.PDBRecognizer
    • chemaxon.formats.recognizer.PeptideRecognizer
    • chemaxon.formats.recognizer.SMILESRecognizer
    • chemaxon.formats.recognizer.XYZRecognizer
      • chemaxon.formats.recognizer.CubeRecognizer
  • chemaxon.formats.recognizer.RecognizerList
  • chemaxon.util.concurrent.marvin.ReusableInputProducer (implements chemaxon.util.concurrent.InputProducer<V>)
  • chemaxon.calculations.Ring (implements chemaxon.license.Licensable)
  • chemaxon.marvin.alignment.RotatableBondDetector
  • chemaxon.marvin.services.ServiceArgument<T>
    • chemaxon.marvin.services.DynamicArgument<CT,RT>
  • chemaxon.marvin.services.ServiceDescriptor
    • chemaxon.marvin.services.httpservice.HTTPServiceDescriptor
    • chemaxon.marvin.services.json.JsonServiceDescriptor
    • chemaxon.marvin.services.localservice.LocalServiceDescriptor
    • chemaxon.marvin.services.soap.SoapServiceDescriptor
    • chemaxon.marvin.services.xmlrpcservice.XMLRPCServiceDescriptor
  • chemaxon.marvin.services.ServiceDescriptorTools
  • chemaxon.marvin.services.ServiceHandler<DT>
  • chemaxon.struc.Sgroup (implements java.io.Serializable)
    • chemaxon.struc.sgroup.DataSgroup
    • chemaxon.struc.sgroup.MulticenterSgroup
    • chemaxon.struc.sgroup.MultipleSgroup (implements chemaxon.struc.sgroup.Expandable)
    • chemaxon.struc.sgroup.RepeatingUnitSgroup
    • chemaxon.struc.sgroup.SuperatomSgroup (implements chemaxon.core.structure.AbbreviationForBuilder<A>, chemaxon.struc.sgroup.Expandable)
  • java.beans.SimpleBeanInfo (implements java.beans.BeanInfo)
    • chemaxon.marvin.beans.MarvinPaneBeanInfo
      • chemaxon.marvin.beans.MSketchPaneBeanInfo
      • chemaxon.marvin.beans.MViewPaneBeanInfo
  • chemaxon.marvin.io.formats.smiles.SmartsAtomQuerifier (implements chemaxon.marvin.modules.smarts.SmartsAtomTreeParserTreeConstants)
  • com.chemaxon.calculations.solubility.SolubilityCalculator
  • com.chemaxon.calculations.solubility.SolubilityCategories
  • com.chemaxon.calculations.solubility.SolubilityCategories.UndefinedSolubilityCategory (implements com.chemaxon.calculations.solubility.SolubilityCategory)
  • com.chemaxon.calculations.stereoanal.StereoAnalysis
  • chemaxon.checkers.StereoCheckUtility
  • chemaxon.calculations.stereo.Stereochemistry
  • chemaxon.checkers.StructureCheck
  • chemaxon.checkers.StructureCheckerDescriptor (implements java.lang.Cloneable)
  • chemaxon.checkers.StructureCheckerFactory
  • chemaxon.checkers.StructureCheckerHelper
  • chemaxon.checkers.StructureCheckerUtility
  • chemaxon.checkers.StructureCheckOptions
  • chemaxon.checkers.StructureCheckOptions.ModeConverter (implements com.beust.jcommander.IStringConverter<T>)
  • chemaxon.checkers.StructureCheckOptions.TypeConverter (implements com.beust.jcommander.IStringConverter<T>)
  • chemaxon.fixers.StructureFixerDescriptor (implements java.lang.Cloneable)
  • chemaxon.fixers.StructureFixerFactory
  • chemaxon.formats.documents.jchemexcel.StructureToJC4XL
  • chemaxon.marvin.space.SurfaceColoring
  • chemaxon.marvin.util.SwingUtil (implements java.io.Serializable)
  • chemaxon.marvin.view.swing.TableOptions
  • chemaxon.marvin.view.swing.TableSupport
  • com.chemaxon.calculations.stereoanal.stereocenters.TetrahedralStereoCenter (implements com.chemaxon.calculations.stereoanal.stereocenters.StereoCenter)
  • java.lang.Throwable (implements java.io.Serializable)
    • java.lang.Exception
      • java.util.concurrent.ExecutionException
        • chemaxon.marvin.plugin.concurrent.PluginExecutionException
      • java.io.IOException
        • chemaxon.marvin.io.MolExportException
        • chemaxon.formats.MolFormatException
          • chemaxon.naming.NameFormatException
            • chemaxon.naming.NameFormatException.FilteredCase
            • chemaxon.naming.NamePrefixException
      • chemaxon.marvin.view.MDocStorage.CancellationException
      • chemaxon.marvin.view.MDocStorage.RecordUnavailableException
      • chemaxon.marvin.io.MRecordParseException
      • chemaxon.marvin.plugin.PluginException
      • chemaxon.marvin.services.ServiceException
  • chemaxon.calculations.TopologyAnalyser (implements chemaxon.license.Licensable)
  • chemaxon.marvin.modules.datatransfer.TransferableDescriptor (implements java.lang.Comparable<T>)
  • chemaxon.marvin.common.UserSettings
  • chemaxon.core.calculations.valencecheck.ValenceCheckOptions (implements java.io.Serializable)
  • chemaxon.core.calculations.valencecheck.ValenceCheckOptions.Builder
  • com.chemaxon.version.VersionInfo
  • chemaxon.checkers.runner.configuration.reader.XMLBasedConfigurationReader (implements chemaxon.checkers.runner.configuration.reader.ConfigurationReader)

Interface Hierarchy

• chemaxon.marvin.alignment.AlignmentMoleculeFactory.ProgressBarInterface
• chemaxon.marvin.services.AsyncCallback<T>
• java.util.concurrent.Callable<V>
  • chemaxon.util.concurrent.WorkUnit
• chemaxon.marvin.util.CallbackIface
  • chemaxon.jep.ChemContext (also extends java.io.Serializable)
• chemaxon.util.Cancelable
  • chemaxon.util.concurrent.ConcurrentProcessor (also extends chemaxon.util.concurrent.util.ConcurrentIterator<V>)
• chemaxon.checkers.runner.CheckerRunner
• chemaxon.struc.CIPStereoDescriptorIface
• chemaxon.struc.CIPStereoDescriptorIface.CIPValue
• chemaxon.util.concurrent.util.ConcurrentIterator<V>
  • chemaxon.util.concurrent.ConcurrentProcessor (also extends chemaxon.util.Cancelable)
  • chemaxon.util.concurrent.InputProducer<V>
• chemaxon.checkers.runner.configuration.reader.ConfigurationReader
• chemaxon.marvin.util.CopyOptConstants
• chemaxon.marvin.paint.DispOptConsts
• chemaxon.naming.DocumentExtractor.ProgressListener
• chemaxon.util.ErrorProcessor
• chemaxon.struc.sgroup.Expandable
• chemaxon.jep.FingerprintGenerator
• chemaxon.struc.HybridizationStateConsts
• chemaxon.struc.Incomplecule
  • chemaxon.struc.Smolecule
    • chemaxon.struc.WSmolecule
  • chemaxon.struc.WSmolecule
• java.util.Iterator<E>
  • chemaxon.util.iterator.MoleculeIterator
• chemaxon.marvin.space.MacroMoleculeComponent.MoleculeVisualizer
• com.chemaxon.mapper.Mapper<T>
• chemaxon.marvin.view.MDocStorage.Listener
• chemaxon.jep.MolCondition
• chemaxon.util.MolFilter
• chemaxon.common.util.MProgressMonitor
• chemaxon.marvin.io.MRecordReader
• chemaxon.struc.MTransformable
• chemaxon.naming.NameConverter
• chemaxon.marvin.alignment.PairwiseComparison
• chemaxon.marvin.plugin.ParameterPanelHandler
• java.io.Serializable
  • chemaxon.jep.ChemContext (also extends chemaxon.marvin.util.CallbackIface)
• chemaxon.marvin.services.ServiceDescriptorEditor<T>
• chemaxon.marvin.services.ServiceDescriptorEditorProvider
• chemaxon.marvin.services.ServiceDescriptorReader
• chemaxon.marvin.services.ServiceDescriptorWriter
• chemaxon.marvin.services.ServiceDialogProvider
• com.chemaxon.calculations.solubility.SolubilityCategory
• com.chemaxon.calculations.solubility.SolubilityResult
• chemaxon.jep.Standardizer
• com.chemaxon.calculations.stereoanal.stereocenters.StereoCenter
• com.chemaxon.calculations.stereoanal.filters.StereoCenterVisitor
• chemaxon.struc.StereoConstants
• com.chemaxon.calculations.stereoanal.StereoConstants
• com.chemaxon.calculations.stereoanal.StereoConstants.StereoValue
• chemaxon.marvin.calculations.StructuralFrameworksPlugin.VerbosePrinter
• chemaxon.checkers.StructureChecker
• chemaxon.checkers.result.StructureCheckerResult
  • chemaxon.checkers.result.ExternalStructureCheckerResult
• chemaxon.fixers.StructureFixer
• chemaxon.marvin.view.TaskScheduler
• java.awt.datatransfer.Transferable
  • chemaxon.marvin.modules.datatransfer.MTransferable
• chemaxon.util.concurrent.WorkUnitFactory

Annotation Type Hierarchy

• chemaxon.fixers.FixerInfo (implements java.lang.annotation.Annotation)
• chemaxon.fixers.FixesExternal (implements java.lang.annotation.Annotation)
• chemaxon.fixers.Fixes (implements java.lang.annotation.Annotation)
• chemaxon.checkers.CheckerInfo (implements java.lang.annotation.Annotation)
• chemaxon.checkers.Persistent (implements java.lang.annotation.Annotation)
• com.chemaxon.common.annotations.SubjectToRemoval (implements java.lang.annotation.Annotation)

Enum Hierarchy

• java.lang.Object
  • java.lang.Enum<E> (implements java.lang.Comparable<T>, java.io.Serializable)
    • chemaxon.calculations.nmr.NMRSpectrum.Nucleus
    • chemaxon.calculations.nmr.NMRSpectrum.Unit
    • chemaxon.calculations.dipole.DipoleResult.Unit
    • chemaxon.struc.MoleculeGraph.ValenceCheckState
    • chemaxon.struc.CIPStereoDescriptorIface.CIPValue.TetrahedralStereoIUPACValue (implements chemaxon.struc.CIPStereoDescriptorIface.CIPValue)
    • chemaxon.struc.CIPStereoDescriptorIface.CIPValue.TetrahedralStereoValue (implements chemaxon.struc.CIPStereoDescriptorIface.CIPValue)
    • chemaxon.struc.CIPStereoDescriptorIface.CIPValue.AxialStereoIUPACValue (implements chemaxon.struc.CIPStereoDescriptorIface.CIPValue)
    • chemaxon.struc.CIPStereoDescriptorIface.CIPValue.AxialStereoValue (implements chemaxon.struc.CIPStereoDescriptorIface.CIPValue)
    • chemaxon.struc.CIPStereoDescriptorIface.CIPValue.AtropStereoIUPACValue (implements chemaxon.struc.CIPStereoDescriptorIface.CIPValue)
    • chemaxon.struc.CIPStereoDescriptorIface.CIPValue.AtropStereoValue (implements chemaxon.struc.CIPStereoDescriptorIface.CIPValue)
    • chemaxon.struc.CIPStereoDescriptorIface.CIPValue.CisTransStereoIUPACValue (implements chemaxon.struc.CIPStereoDescriptorIface.CIPValue)
    • chemaxon.struc.CIPStereoDescriptorIface.CIPValue.CisTransStereoValue (implements chemaxon.struc.CIPStereoDescriptorIface.CIPValue)
    • chemaxon.struc.CIPStereoDescriptorIface.CIPType
    • chemaxon.struc.AtomProperty.Radical
    • chemaxon.struc.SgroupType
    • chemaxon.marvin.calculations.StructuralFrameworksPlugin.FrameworkTypes
    • chemaxon.marvin.services.json.JsonServiceDescriptor.Method
    • chemaxon.marvin.alignment.AtropIsomerDetector.Accuracy
    • chemaxon.marvin.alignment.AlignmentAccuracyMode
    • chemaxon.marvin.alignment.AlignmentProperties (implements java.io.Serializable)
    • chemaxon.marvin.alignment.AlignmentProperties.ColorNotSpecifiedCase
    • chemaxon.marvin.alignment.AlignmentProperties.ColoringScheme (implements java.io.Serializable)
    • chemaxon.marvin.alignment.AlignmentProperties.OrientationType (implements java.io.Serializable)
    • chemaxon.marvin.alignment.AlignmentProperties.FlexibilityMode
    • chemaxon.marvin.alignment.AlignmentProperties.DegreeOfFreedomType
    • chemaxon.marvin.alignment.AlignmentProperties.NodeType (implements java.io.Serializable)
    • chemaxon.marvin.io.MolImportModule.PreferredView
    • chemaxon.checkers.StructureCheckerErrorType
    • chemaxon.checkers.CheckerSeverity
    • chemaxon.checkers.FixMode
    • chemaxon.checkers.StructureCheckOptions.Mode
    • chemaxon.checkers.StructureCheckOptions.Type
    • com.chemaxon.calculations.solubility.SolubilityUnit
    • com.chemaxon.calculations.solubility.DefaultSolubilityCategory (implements com.chemaxon.calculations.solubility.SolubilityCategory)
    • com.chemaxon.calculations.stereoanal.StereoConstants.Type
    • com.chemaxon.calculations.stereoanal.StereoConstants.StereoValue.TetrahedralStereo (implements com.chemaxon.calculations.stereoanal.StereoConstants.StereoValue)
    • com.chemaxon.calculations.stereoanal.StereoConstants.StereoValue.CisTransStereo (implements com.chemaxon.calculations.stereoanal.StereoConstants.StereoValue)
    • com.chemaxon.calculations.stereoanal.StereoConstants.StereoValue.AxialStereo (implements com.chemaxon.calculations.stereoanal.StereoConstants.StereoValue)
    • com.chemaxon.calculations.stereoanal.StereoConstants.StereoValue.AtropStereo (implements com.chemaxon.calculations.stereoanal.StereoConstants.StereoValue)
    • com.chemaxon.calculations.stereoanal.StereoConstants.EnhancedStereoType
    • com.chemaxon.mapper.Mapper.MappingStyle
    • com.chemaxon.common.annotations.RemovalDate